Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TINF2Q9BSI4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms