Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SGIP1Q9BQI5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms