Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CITED2Q99967 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms