Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms