Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms