Protein–RNA interactions for Protein: Q96S52

PIGS, GPI transamidase component PIG-S, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGSQ96S52 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PIGSQ96S52 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms