Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPS6KC1Q96S38 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPS6KC1Q96S38 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPS6KC1Q96S38 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPS6KC1Q96S38 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPS6KC1Q96S38 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPS6KC1Q96S38 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPS6KC1Q96S38 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPS6KC1Q96S38 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPS6KC1Q96S38 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPS6KC1Q96S38 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPS6KC1Q96S38 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RPS6KC1Q96S38 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RPS6KC1Q96S38 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPS6KC1Q96S38 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPS6KC1Q96S38 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPS6KC1Q96S38 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPS6KC1Q96S38 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPS6KC1Q96S38 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPS6KC1Q96S38 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPS6KC1Q96S38 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPS6KC1Q96S38 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPS6KC1Q96S38 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPS6KC1Q96S38 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPS6KC1Q96S38 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPS6KC1Q96S38 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPS6KC1Q96S38 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPS6KC1Q96S38 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPS6KC1Q96S38 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPS6KC1Q96S38 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPS6KC1Q96S38 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPS6KC1Q96S38 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPS6KC1Q96S38 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPS6KC1Q96S38 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPS6KC1Q96S38 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPS6KC1Q96S38 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPS6KC1Q96S38 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPS6KC1Q96S38 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPS6KC1Q96S38 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPS6KC1Q96S38 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RPS6KC1Q96S38 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPS6KC1Q96S38 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPS6KC1Q96S38 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPS6KC1Q96S38 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPS6KC1Q96S38 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPS6KC1Q96S38 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPS6KC1Q96S38 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPS6KC1Q96S38 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPS6KC1Q96S38 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms