Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC9Q96Q05 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms