Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCLT1Q96NL6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms