Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF396Q96N95 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms