Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms