Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms