Protein–RNA interactions for Protein: Q96LI9

CXorf58, Putative uncharacterized protein CXorf58, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf58Q96LI9 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CXorf58Q96LI9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms