Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAMP1Q96JM3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms