Protein–RNA interactions for Protein: Q96HW7

INTS4, Integrator complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS4Q96HW7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
INTS4Q96HW7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
INTS4Q96HW7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
INTS4Q96HW7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
INTS4Q96HW7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
INTS4Q96HW7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
INTS4Q96HW7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
INTS4Q96HW7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
INTS4Q96HW7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
INTS4Q96HW7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
INTS4Q96HW7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
INTS4Q96HW7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
INTS4Q96HW7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
INTS4Q96HW7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
INTS4Q96HW7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
INTS4Q96HW7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
INTS4Q96HW7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
INTS4Q96HW7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
INTS4Q96HW7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
INTS4Q96HW7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
INTS4Q96HW7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
INTS4Q96HW7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
INTS4Q96HW7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
INTS4Q96HW7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms