Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
DDX11Q96FC9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX11Q96FC9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms