Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms