Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms