Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms