Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms