Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
HPS3Q969F9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPS3Q969F9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPS3Q969F9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPS3Q969F9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPS3Q969F9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPS3Q969F9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPS3Q969F9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPS3Q969F9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPS3Q969F9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPS3Q969F9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPS3Q969F9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPS3Q969F9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPS3Q969F9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPS3Q969F9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HPS3Q969F9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPS3Q969F9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPS3Q969F9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS3Q969F9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS3Q969F9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS3Q969F9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS3Q969F9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS3Q969F9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS3Q969F9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS3Q969F9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS3Q969F9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS3Q969F9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS3Q969F9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS3Q969F9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS3Q969F9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS3Q969F9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS3Q969F9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS3Q969F9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS3Q969F9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS3Q969F9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS3Q969F9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS3Q969F9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS3Q969F9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS3Q969F9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS3Q969F9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS3Q969F9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS3Q969F9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS3Q969F9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS3Q969F9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS3Q969F9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS3Q969F9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS3Q969F9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS3Q969F9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HPS3Q969F9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HPS3Q969F9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms