Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATRIPQ8WXE1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms