Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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COPS9Q8WXC6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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