Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms