Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNNM3Q8NE01 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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