Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms