Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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