Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms