Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5C6

SRBD1, S1 RNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 995 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRBD1Q8N5C6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms