Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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CHCHD4Q8N4Q1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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CHCHD4Q8N4Q1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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