Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms