Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYA6

CKAP2L, Cytoskeleton-associated protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2LQ8IYA6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CKAP2LQ8IYA6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKAP2LQ8IYA6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms