Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms