Protein–RNA interactions for Protein: Q86V59

PNMA8A, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8AQ86V59 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA8AQ86V59 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA8AQ86V59 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA8AQ86V59 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA8AQ86V59 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA8AQ86V59 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA8AQ86V59 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA8AQ86V59 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA8AQ86V59 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA8AQ86V59 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA8AQ86V59 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA8AQ86V59 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA8AQ86V59 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA8AQ86V59 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA8AQ86V59 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA8AQ86V59 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms