Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
C9orf47Q6ZRZ4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms