Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFXL1Q6ZNB6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms