Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC171Q6TFL3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms