Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
APOBEC3HQ6NTF7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms