Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
CARMIL2Q6F5E8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CARMIL2Q6F5E8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms