Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNS3Q68CZ2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNS3Q68CZ2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNS3Q68CZ2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNS3Q68CZ2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNS3Q68CZ2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNS3Q68CZ2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNS3Q68CZ2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNS3Q68CZ2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNS3Q68CZ2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNS3Q68CZ2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNS3Q68CZ2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNS3Q68CZ2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNS3Q68CZ2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNS3Q68CZ2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TNS3Q68CZ2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNS3Q68CZ2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNS3Q68CZ2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TNS3Q68CZ2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNS3Q68CZ2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNS3Q68CZ2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNS3Q68CZ2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TNS3Q68CZ2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNS3Q68CZ2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms