Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CREB3L3Q68CJ9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CREB3L3Q68CJ9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms