Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATRNL1Q5VV63 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms