Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FRMPD1Q5SYB0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms