Protein–RNA interactions for Protein: Q5NUL3

FFAR4, Free fatty acid receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FFAR4Q5NUL3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FFAR4Q5NUL3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FFAR4Q5NUL3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FFAR4Q5NUL3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FFAR4Q5NUL3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FFAR4Q5NUL3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FFAR4Q5NUL3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FFAR4Q5NUL3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FFAR4Q5NUL3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FFAR4Q5NUL3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FFAR4Q5NUL3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FFAR4Q5NUL3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FFAR4Q5NUL3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FFAR4Q5NUL3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FFAR4Q5NUL3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FFAR4Q5NUL3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FFAR4Q5NUL3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FFAR4Q5NUL3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FFAR4Q5NUL3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FFAR4Q5NUL3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FFAR4Q5NUL3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FFAR4Q5NUL3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FFAR4Q5NUL3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FFAR4Q5NUL3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FFAR4Q5NUL3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FFAR4Q5NUL3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FFAR4Q5NUL3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FFAR4Q5NUL3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FFAR4Q5NUL3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FFAR4Q5NUL3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FFAR4Q5NUL3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FFAR4Q5NUL3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FFAR4Q5NUL3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FFAR4Q5NUL3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FFAR4Q5NUL3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FFAR4Q5NUL3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms