Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC178Q5BJE1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms