Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms