Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms