Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TMEM259Q4ZIN3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms