Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms