Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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USP41Q3LFD5 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP41Q3LFD5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP41Q3LFD5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
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